158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1433 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
320 aa  624  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  32.42 
 
 
361 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  33.77 
 
 
325 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  31.33 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  26.64 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.38 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  23.72 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  21.61 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.42 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  21.86 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.55 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  21.9 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  21.05 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.34 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.52 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.77 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  22.58 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.36 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  24.68 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  24.68 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.15 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  21.96 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  20.85 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.48 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.05 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  26.9 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.62 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.26 
 
 
297 aa  67  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  24.35 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  24.03 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  21.19 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.42 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  22.52 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  22.52 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23.42 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.16 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.52 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  23.42 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.52 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  21.93 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  21.66 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  25.59 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.8 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  22.01 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  23.56 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  22.01 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.43 
 
 
296 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  20.89 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  20.85 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  21.6 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  27.92 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  21.81 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  22.82 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.7 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  22.78 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  22.84 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.39 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.01 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  28.38 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  21.82 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  20.57 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  22.54 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  18.66 
 
 
293 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  21.24 
 
 
302 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  22.98 
 
 
309 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  19.75 
 
 
305 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  23.12 
 
 
325 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  24.55 
 
 
292 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  23.36 
 
 
308 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  32.11 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  22.61 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  19.02 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  20.41 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  27.21 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.57 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  19.34 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  20 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  22.4 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  25.97 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  25.55 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.66 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  25.68 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  20.13 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  24 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  22.22 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  26.86 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  23.64 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.82 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  23.44 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>