More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4023 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3813  UspA domain protein  76.92 
 
 		 142 aa  213  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3285  UspA domain protein  61.87 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  39.46 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  36.11 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  35.92 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  32.64 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.79 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.86 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  34.23 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  35.86 
 
 		 274 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.24 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  25.9 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  34.75 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  33.57 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  31.11 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.5 
 
 		 320 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  27.08 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.76 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.47 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.77 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  30.63 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.21 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.94 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  35.77 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 287 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  33.57 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  43.21 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.17 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.47 
 
 		 145 aa  50.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 167 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.43 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  31.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  29.37 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.65 
 
 		 283 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.77 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  34.56 
 
 		 280 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  38.03 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.19 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  40.68 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  35.86 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  31.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  32.43 
 
 		 288 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  31.03 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.4 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 295 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.61 
 
 		 295 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  31.68 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  25.34 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 295 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.59 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  24.53 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  28.17 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  29.63 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.47 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  32.17 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  28.17 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  35.04 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.97 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.26 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  32.58 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  30.71 
 
 		 309 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.03 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.01 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  28.97 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  23.53 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>