275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3379 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  38.82 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  34 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.89 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  31.17 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  29.44 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 414 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  28.68 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  29.91 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  29.87 
 
 		 530 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 378 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  31.49 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  33.42 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.03 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  38.38 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  28.08 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 		 440 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  27 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  26.37 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  27.5 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  32.56 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  27.1 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  24.84 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  27 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4370  major facilitator transporter  30 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 462 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 462 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  29.11 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  26.95 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>