More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0300 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 407 aa  761    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  46.48 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  44.19 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  41.82 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  39.42 
 
 		 399 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  38.58 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  41.1 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  39.65 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  39.21 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.64 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  42.46 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  40.32 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.49 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.23 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.1 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 398 aa  209  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  42.2 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.14 
 
 		 390 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  41.25 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.54 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  33.5 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  38.99 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  38.88 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  37.22 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  37.28 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  37.7 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  39.63 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  46.91 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.41 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.9 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.76 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.45 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.87 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  30.96 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.91 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2405  RND family efflux transporter MFP subunit  25.48 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  30.52 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.23 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 		 407 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  23.32 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  25.52 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  25.63 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  24.57 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  23.85 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.6 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.06 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.03 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.06 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  23.91 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  21.37 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  24.4 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.73 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.28 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  23.26 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  28.13 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  27.34 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  22.85 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.34 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>