206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4671 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  55.47 
 
 
138 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  54.76 
 
 
138 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  54.4 
 
 
140 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  53.6 
 
 
140 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  46.03 
 
 
332 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  48.85 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  44.8 
 
 
131 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  45.67 
 
 
323 aa  114  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  44.8 
 
 
324 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  44.44 
 
 
332 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  41.6 
 
 
144 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  39.23 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  44.7 
 
 
145 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  37.88 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  37.4 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.88 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  37.4 
 
 
178 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  37.9 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  36.67 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  41.24 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.72 
 
 
265 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  38.21 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  36.22 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  38.21 
 
 
173 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  35.94 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  37.3 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  37.25 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  35.71 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  39.85 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  36.59 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.3 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  38.21 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  39.2 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  39.2 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  31.82 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  40.83 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  35.43 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  38.93 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  36.59 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  36 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  35.83 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  34.65 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  32.54 
 
 
271 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  36.8 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  35.35 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 
205 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  32.82 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  34.88 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  34.38 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  38.76 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  39.37 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  32.81 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  31.01 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  34.78 
 
 
237 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.22 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  35 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  38.52 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  34.92 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.92 
 
 
311 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  32.56 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  36.76 
 
 
251 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.15 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  37.21 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.81 
 
 
235 aa  70.5  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  35.77 
 
 
238 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  34.78 
 
 
233 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  28.35 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  34.17 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  37.5 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  34.31 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  37.04 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  37.04 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  32.81 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  35.66 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  33.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  36.08 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  34.11 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  32.71 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  32.84 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.17 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  31.78 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  32.85 
 
 
172 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  33.09 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  34.13 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  29.23 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  36.76 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  37.36 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  36.76 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>