More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1435 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  100 
 
 
545 aa  1088    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.24 
 
 
458 aa  309  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.94 
 
 
482 aa  307  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 
464 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.96 
 
 
457 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.61 
 
 
481 aa  300  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.59 
 
 
476 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.42 
 
 
461 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.42 
 
 
476 aa  286  9e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  41.2 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.44 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  39.71 
 
 
524 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  37.08 
 
 
479 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.59 
 
 
502 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  36.25 
 
 
511 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.59 
 
 
502 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.59 
 
 
502 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  37.97 
 
 
502 aa  281  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.54 
 
 
485 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.58 
 
 
502 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.58 
 
 
502 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.38 
 
 
504 aa  280  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.58 
 
 
485 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.58 
 
 
461 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.51 
 
 
475 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.53 
 
 
480 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  38.87 
 
 
494 aa  279  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.25 
 
 
479 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  38.96 
 
 
484 aa  278  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.88 
 
 
477 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  37.37 
 
 
495 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  41.13 
 
 
525 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.17 
 
 
477 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.08 
 
 
477 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.92 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  37.76 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  37.16 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  37.16 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  37.16 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  37.16 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.75 
 
 
481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  37.16 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  37.16 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  39.71 
 
 
523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  37.16 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  38.57 
 
 
494 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  38.38 
 
 
467 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  36.35 
 
 
472 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  38 
 
 
475 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  38.36 
 
 
494 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  36.86 
 
 
473 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  37.95 
 
 
493 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.96 
 
 
479 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  37.95 
 
 
493 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  37.95 
 
 
494 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  38.25 
 
 
489 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.91 
 
 
474 aa  269  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  39.92 
 
 
524 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.45 
 
 
502 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  37.95 
 
 
467 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  37.82 
 
 
473 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  35.8 
 
 
506 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  37.74 
 
 
493 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  37.83 
 
 
492 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.35 
 
 
485 aa  267  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  37.92 
 
 
499 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  38.66 
 
 
472 aa  266  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  37.92 
 
 
499 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  37.3 
 
 
500 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.34 
 
 
471 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.97 
 
 
466 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.32 
 
 
503 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38.53 
 
 
469 aa  266  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.71 
 
 
474 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  37.63 
 
 
503 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.76 
 
 
474 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  37.53 
 
 
506 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  39.57 
 
 
489 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  39.31 
 
 
503 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  36.88 
 
 
503 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.33 
 
 
513 aa  263  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  36.49 
 
 
504 aa  263  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  37.53 
 
 
493 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  37.39 
 
 
464 aa  262  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  37.17 
 
 
498 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  38.62 
 
 
514 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  37.17 
 
 
498 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  37.53 
 
 
473 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  37.17 
 
 
498 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  39.04 
 
 
535 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.38 
 
 
482 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.12 
 
 
473 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  35.62 
 
 
476 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  37.4 
 
 
473 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.51 
 
 
505 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  38.99 
 
 
526 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  38.89 
 
 
504 aa  259  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.4 
 
 
490 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.18 
 
 
476 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.82 
 
 
412 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>