124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1950 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.08 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.78 
 
 
309 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  35.47 
 
 
302 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  33.74 
 
 
298 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.16 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.19 
 
 
299 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  40.87 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  34.35 
 
 
303 aa  126  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  37.63 
 
 
303 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.27 
 
 
301 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  40.53 
 
 
297 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  28.63 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.77 
 
 
311 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.61 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.8 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  43.51 
 
 
139 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  25.75 
 
 
297 aa  101  1e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  29.01 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.95 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.31 
 
 
290 aa  87  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  26.69 
 
 
311 aa  79  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  29.05 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  46.3 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.05 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  34 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.57 
 
 
1031 aa  70.5  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.14 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  31.54 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.32 
 
 
401 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  31.95 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.35 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  30.57 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  25.96 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
553 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.14 
 
 
402 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  27.52 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.73 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  27.66 
 
 
545 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.7 
 
 
331 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  27.01 
 
 
300 aa  62.4  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  24.77 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.58 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 
325 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.67 
 
 
550 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.44 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.94 
 
 
341 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.44 
 
 
325 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  28.85 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  30.25 
 
 
336 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.53 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.46 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.67 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.87 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.68 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  28.93 
 
 
727 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  32.11 
 
 
594 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  21.84 
 
 
404 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.82 
 
 
338 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.82 
 
 
343 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.46 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.03 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.29 
 
 
731 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  24.4 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.31 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.39 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.15 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  29.67 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  34.95 
 
 
731 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  31.39 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.39 
 
 
339 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  29.07 
 
 
691 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  34.95 
 
 
207 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.99 
 
 
580 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.12 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.21 
 
 
342 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.19 
 
 
338 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  40.95 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.43 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.2 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  31.17 
 
 
342 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  27.97 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.07 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  17.96 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.2 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.97 
 
 
570 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  34.69 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  31.25 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  22.18 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.36 
 
 
332 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.7 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  25.76 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.32 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  36.5 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  32.85 
 
 
339 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.79 
 
 
319 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  36.99 
 
 
558 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.71 
 
 
350 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 
384 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.72 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>