126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0228 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0228  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
467 aa  917    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.390102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
597 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 
767 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
366 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 
689 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
927 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 
2240 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 
1276 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 
1034 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
562 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.72 
 
 
363 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.72 
 
 
363 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
1005 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
450 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  31.2 
 
 
1067 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.58 
 
 
576 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
4079 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 
1014 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  32.99 
 
 
681 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.97 
 
 
622 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.01 
 
 
267 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
1737 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
878 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
287 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
3145 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.28 
 
 
764 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 
566 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  35.82 
 
 
1154 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  32.35 
 
 
191 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
860 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 
648 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
329 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.23 
 
 
632 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
892 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
2262 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.7 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.24 
 
 
1979 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
1297 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
265 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
467 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 
723 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 
573 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.22 
 
 
725 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 
296 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.08 
 
 
875 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.82 
 
 
1676 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
543 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.93 
 
 
2401 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
1252 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.34 
 
 
917 aa  47  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.98 
 
 
883 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.16 
 
 
1056 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 
436 aa  47  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
3172 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  32.76 
 
 
321 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
688 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
2262 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 
297 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
935 aa  47  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 
297 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
708 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.5 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.91 
 
 
349 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
934 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
757 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
412 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1049 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 
673 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
3035 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
402 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.54 
 
 
561 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  33.61 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
715 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
505 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.44 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 
311 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
602 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.54 
 
 
561 aa  45.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
250 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.15 
 
 
810 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  28.64 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
564 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
1486 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
3560 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
201 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.36 
 
 
707 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.71 
 
 
330 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.96 
 
 
929 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 
358 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.56 
 
 
745 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
573 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
409 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
317 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.53 
 
 
661 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>