More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0426 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 278 aa  563  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  74.53 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  76.45 
 
 		 281 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  74.53 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  66.79 
 
 		 314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  61.87 
 
 		 260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  59.14 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  58.99 
 
 		 274 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  60.22 
 
 		 272 aa  323  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  36.24 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  27.8 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  27.8 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  28.57 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  27.34 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  28.33 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  26.07 
 
 		 432 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  29.02 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  27.31 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  28.68 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  27.44 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  27.38 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  26.92 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  26.92 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  60.47 
 
 		 896 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  27.27 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  25.19 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 888 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  26.89 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 1031 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 1029 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 864 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  24.81 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  24.81 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  24.81 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  83.33 
 
 		 420 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  25.96 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 845 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  26.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  26.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  26.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  26.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  26.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 837 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  23.55 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 872 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  79.17 
 
 		 593 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  24.71 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 921 aa  52.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  52.27 
 
 		 535 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 384 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 838 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  44.29 
 
 		 110 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  23.66 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 1200 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  67.86 
 
 		 111 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  60 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  71.43 
 
 		 993 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  57.14 
 
 		 421 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 848 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  53.66 
 
 		 830 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 834 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  72 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  58.97 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  74.07 
 
 		 110 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  26.49 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  36.94 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  71.43 
 
 		 110 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 858 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 897 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  60.61 
 
 		 908 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 866 aa  49.7  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 910 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 907 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  61.29 
 
 		 61 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  65.71 
 
 		 970 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 165 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 912 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  52.38 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 917 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 800 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  94.74 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 1136 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 922 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 842 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  40.85 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  45.45 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 844 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  44.44 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 896 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 731 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 837 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 921 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  85.71 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2351  hypothetical protein  51.02 
 
 		 66 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  65.62 
 
 		 962 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 859 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 909 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  46.51 
 
 		 958 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>