95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0094 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  83.33 
 
 		 247 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  80.82 
 
 		 245 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  79.67 
 
 		 258 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  79.25 
 
 		 244 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  79.25 
 
 		 244 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  81.25 
 
 		 245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  79.75 
 
 		 246 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  65.83 
 
 		 245 aa  324  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  54.62 
 
 		 238 aa  262  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  52.74 
 
 		 246 aa  254  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  46.22 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  46.19 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  44.63 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  34.73 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.3 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.42 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.7 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  32 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.56 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.73 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.4 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.32 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  27.2 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  26.84 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.32 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  29.19 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  31.06 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  34.58 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.12 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  25.25 
 
 		 350 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26.29 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  26.81 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  29.17 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.64 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25.96 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  26.15 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  23.58 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.42 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.63 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  24.1 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  32.71 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  26.62 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.17 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.17 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.17 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.17 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.17 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.58 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  26.42 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  24.71 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  23.44 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  23.72 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  23.58 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  28.57 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  26.67 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.58 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23.75 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  24.75 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  22.76 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  23.35 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  24.7 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  24.68 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  25.91 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  31.88 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.23 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.01 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  30.83 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.13 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  22.86 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  26.84 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  26.27 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28.18 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  24.26 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  24.63 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  29.19 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  23.98 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.77 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  24.88 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  23.15 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25.13 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  29.51 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  23.5 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  25.89 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  27.19 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  24.87 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  27.73 
 
 		 358 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  27.22 
 
 		 295 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  26.72 
 
 		 283 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 359 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>