More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2590 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 360 aa  731    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  53.04 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  51.59 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  50.89 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  50.86 
 
 		 354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  48.12 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  48.71 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  48.98 
 
 		 352 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  48.08 
 
 		 340 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  48.67 
 
 		 340 aa  348  8e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  47.49 
 
 		 340 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  47.8 
 
 		 339 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  48.68 
 
 		 401 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  50.73 
 
 		 361 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 339 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 339 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  47.94 
 
 		 355 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  47.32 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  49.38 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  47.31 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 		 345 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  47.09 
 
 		 345 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  46.9 
 
 		 356 aa  325  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  45.72 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 		 348 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  47.46 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  43.36 
 
 		 357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  43.86 
 
 		 348 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  46.04 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  47.26 
 
 		 368 aa  315  7e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  48.12 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  47.66 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 344 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  47.21 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 345 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 345 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  45.85 
 
 		 354 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  47.11 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  46.91 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  47.23 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  47.23 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  47.23 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  45.05 
 
 		 352 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 		 351 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  47.26 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 353 aa  288  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 		 351 aa  288  9e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  46.4 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  45.01 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  44.21 
 
 		 354 aa  285  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  41.4 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  41.42 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 351 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  43.03 
 
 		 349 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  41.57 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  42.35 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.35 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  43.24 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  41.21 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.05 
 
 		 348 aa  278  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  41.57 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  42.6 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  41.46 
 
 		 350 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  42.24 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  42.53 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  43.95 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  40.3 
 
 		 339 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  43.1 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  43.95 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  41.64 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  43.71 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>