290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2046 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  47.1 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  41.43 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  36.86 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  40.08 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  39.62 
 
 		 332 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  36.65 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  37.93 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  34.94 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  38.33 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  36.82 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  36.54 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  36.98 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  35.85 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  34.83 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  36.89 
 
 		 331 aa  138  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  36.36 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  36.08 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  35.88 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  31.03 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  35.11 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  36.03 
 
 		 324 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  33.09 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  33.33 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.33 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.33 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  34.93 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  35.92 
 
 		 310 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  34.41 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  32.84 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  29.89 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  35.88 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  37.08 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  30.27 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.73 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  33.81 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.48 
 
 		 317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  34.6 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  32.53 
 
 		 310 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  34.78 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  33.8 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  30.04 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  33.8 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  31.03 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.38 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.7 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  32.98 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  33.09 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  30.6 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  33.6 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  30.97 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  28.74 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  30.07 
 
 		 302 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  34.26 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  30.07 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  32.97 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  33.73 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.73 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  33.86 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  32.25 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  30.43 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  30.32 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  32.5 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  31.54 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  28.83 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  31.01 
 
 		 354 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  33.46 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  32.78 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  32.41 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.83 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  31.78 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  32.94 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  31.44 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  31.99 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  34.94 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  31.52 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  32.73 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  31.78 
 
 		 355 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  31.78 
 
 		 355 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.75 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  30.22 
 
 		 346 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  32.12 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  31.89 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  33.07 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  31.48 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  30.8 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  33.71 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  32 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  31.16 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  31.2 
 
 		 575 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.6 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  28.57 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  31.16 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  39.15 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  30.55 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  31.85 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  30.83 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>