More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0067 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  97.42 
 
 		 465 aa  858    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 465 aa  914    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  61.3 
 
 		 477 aa  555  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  56.28 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  44.63 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  39.69 
 
 		 524 aa  243  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  36.07 
 
 		 403 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.66 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 		 532 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.69 
 
 		 525 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  33.85 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  35.99 
 
 		 533 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  35.64 
 
 		 534 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  35.1 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  34.63 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  37.64 
 
 		 740 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.84 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.84 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.87 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 554 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 554 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  35.14 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  34.29 
 
 		 533 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.47 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37.79 
 
 		 530 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.29 
 
 		 735 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  43.33 
 
 		 1029 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  35.68 
 
 		 403 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  34.92 
 
 		 530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  37.3 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  35.79 
 
 		 532 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  36.82 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  33.73 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.95 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  38.87 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  35.35 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.95 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.67 
 
 		 995 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.61 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.12 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.5 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  35.22 
 
 		 534 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  35.79 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.92 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  36.22 
 
 		 500 aa  212  9e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.19 
 
 		 762 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  34.57 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.19 
 
 		 991 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  33.83 
 
 		 843 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  32.98 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.32 
 
 		 533 aa  210  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  34.38 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  32.55 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  48.7 
 
 		 1001 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.32 
 
 		 759 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  33.49 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.37 
 
 		 853 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  32.36 
 
 		 554 aa  206  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  45.28 
 
 		 622 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1349  protein-export membrane protein SecD  32.72 
 
 		 997 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.853966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.5 
 
 		 849 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  32.38 
 
 		 416 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  32.04 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.21 
 
 		 995 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.21 
 
 		 623 aa  200  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  31.21 
 
 		 537 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.31 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  35.21 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  35.82 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.08 
 
 		 848 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  34.31 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.93 
 
 		 856 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  34.44 
 
 		 616 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  34.23 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  34.57 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1384  preprotein translocase subunit SecD  37.6 
 
 		 616 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  hitchhiker  0.000000727457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  37.6 
 
 		 616 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  37.6 
 
 		 616 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.09 
 
 		 996 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  34.43 
 
 		 508 aa  197  5.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.87 
 
 		 474 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  30.62 
 
 		 613 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  34.69 
 
 		 614 aa  196  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2482  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 		 616 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000187651  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  34.1 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  35.31 
 
 		 607 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>