More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1479 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  35.16 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  28.21 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  29.58 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  28.72 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.95 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.75 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.96 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  27.01 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  26.88 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  31.91 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  23.64 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 111 aa  62  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  25.74 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  28.04 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27.89 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  26.13 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  45.21 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  24.89 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  28.35 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  25.77 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  45.9 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  39.08 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  27.37 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.78 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  28.87 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  39.02 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.87 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  35.8 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  25.98 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 139 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  35.8 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  37.65 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  41.86 
 
 		 815 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.82 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.35 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  39.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  39.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  39.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  39.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  39.29 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  23.75 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  35 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  34.15 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  26.67 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.46 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  24.88 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.47 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.47 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  24.87 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  34.57 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  30.71 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  41.67 
 
 		 144 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 117 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  37.8 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 104 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  32.79 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  39.51 
 
 		 819 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  25.89 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 374 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  29.03 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  33.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 115 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>