More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0124 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  35.75 
 
 		 283 aa  118  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  41.5 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  37.68 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  34.82 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  35.75 
 
 		 273 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  38.85 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  34.38 
 
 		 278 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  41.06 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  40.4 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  37.89 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  40.94 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  39.6 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  41.03 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  39.44 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  39.69 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  35.57 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  35.26 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  35.67 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.9 
 
 		 279 aa  85.9  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  34.42 
 
 		 326 aa  85.5  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  36.88 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  37.75 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  35.62 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  35.17 
 
 		 310 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  37.42 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  38.06 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  30.81 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  35.29 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  37.58 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  36.73 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  40.43 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  34.64 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  33.17 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  39.8 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  34.64 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  38.89 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  34.64 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  34.64 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  34.64 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.09 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  34.64 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  34.64 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  34.51 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  37.82 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  38.82 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  30.32 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.28 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  36.31 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  30.91 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  37.75 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  31.6 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  37.75 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  30.85 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  34.04 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  35.04 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  31.09 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  33.16 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  35.92 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  32.69 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  34.71 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  40.22 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  32.24 
 
 		 496 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  32.12 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  35.03 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  30.99 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  32.09 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  32.34 
 
 		 519 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  33.7 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.82 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  31.05 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  32.37 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  41.05 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  43.62 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  43.62 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  29.57 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 492 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  30.62 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  30.72 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  31.44 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  38.62 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  31.75 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  26.6 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  39.22 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  33.99 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  27.36 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  31.61 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  33.99 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  28.99 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  33.91 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>