214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0637 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  100 
 
 		 352 aa  732    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  55.56 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  51.48 
 
 		 342 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  49.4 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  46.74 
 
 		 384 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  47.03 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  46.74 
 
 		 398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  47.41 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  47.47 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  47.45 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  46.75 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  46.02 
 
 		 346 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  46.49 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  43.81 
 
 		 323 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  44.94 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  37.68 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  32.35 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.2 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  27.54 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  30.67 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.01 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  29.47 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.25 
 
 		 407 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  29.15 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  30.33 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  35.98 
 
 		 623 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  34.29 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  26.9 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  33.66 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  26.2 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.33 
 
 		 574 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.33 
 
 		 1103 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.17 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.54 
 
 		 533 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.3 
 
 		 555 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.86 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.73 
 
 		 674 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.62 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.2 
 
 		 579 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.97 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.86 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  32.72 
 
 		 944 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.98 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  25.94 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  28.39 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  34.39 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  29.38 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.61 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  32.52 
 
 		 550 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.5 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  32.09 
 
 		 546 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  28.5 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.77 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.86 
 
 		 552 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  33.33 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  32.61 
 
 		 563 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  32.07 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.88 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  24.78 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  30.48 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.65 
 
 		 548 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  32.29 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.81 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  31.89 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  24.51 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  24.51 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  25.95 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  31.22 
 
 		 571 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.52 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  30.11 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  26.91 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.79 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.79 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30 
 
 		 555 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.05 
 
 		 553 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  30.73 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.16 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.4 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  29.25 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.98 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.67 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.98 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  30.29 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.98 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.63 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.26 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  26.47 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.98 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.98 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32.52 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.52 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.52 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  28.29 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.69 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.9 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.96 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.38 
 
 		 552 aa  59.3  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  27.45 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.72 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.1 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>