More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0634 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
186 aa  367  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000563815  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0219  TPR repeat-containing protein  52.72 
 
 
189 aa  191  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
291 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
605 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
448 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  32.28 
 
 
992 aa  61.6  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
265 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
827 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
706 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
465 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1085 aa  58.2  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 
415 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
632 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
423 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
441 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 
291 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 
288 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.18 
 
 
620 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 
441 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
1737 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 
265 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
402 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
265 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
589 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.95 
 
 
795 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
265 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
265 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
718 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 
624 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
643 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.05 
 
 
780 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  27.94 
 
 
864 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
615 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 
729 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30 
 
 
887 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
673 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.14 
 
 
267 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 
1056 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
3301 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24 
 
 
626 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  24 
 
 
614 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24 
 
 
626 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
614 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 
689 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24 
 
 
614 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
614 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  27.15 
 
 
815 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.66 
 
 
632 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.17 
 
 
1676 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
297 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
297 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
3145 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
917 aa  51.2  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 
320 aa  51.6  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
804 aa  51.6  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
593 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 
632 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.7 
 
 
577 aa  51.2  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
722 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000160117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.7 
 
 
577 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
779 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.12 
 
 
594 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.41 
 
 
1022 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
639 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.14 
 
 
1154 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  28.17 
 
 
389 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.97 
 
 
810 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
648 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
466 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
568 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.61 
 
 
916 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  28.17 
 
 
390 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000197215  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
847 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
314 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.44 
 
 
738 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.32 
 
 
816 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
248 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
637 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
611 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 
988 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 
1067 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
635 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
1297 aa  49.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
612 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
780 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
636 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
635 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
544 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  24.34 
 
 
708 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
280 aa  48.9  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>