167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0375 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  90.8 
 
 		 435 aa  833    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 434 aa  908    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  57.6 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  57.37 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  57.6 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  57.14 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  56.68 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  57.31 
 
 		 423 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  55.99 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  42.96 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  36.88 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  36.79 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  35.48 
 
 		 450 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  35.73 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  37.76 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.23 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.58 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.67 
 
 		 422 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  33.86 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  31.14 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  30.03 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  31.13 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.66 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  26.8 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  26.93 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.65 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  28.77 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  26.45 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.65 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  26.72 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  26.6 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27.87 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.67 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  25.95 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  25.95 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  25.95 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  25.95 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 		 439 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  31.37 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  29.17 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.9 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.87 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  28.79 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  29.1 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.08 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  26.92 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  25.99 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  28.32 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  26.42 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  25.18 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  25.12 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  29.67 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  26.78 
 
 		 480 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  26.46 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  26.8 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  28.12 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  29.92 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  25.56 
 
 		 435 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  26.16 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  24.79 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  25.93 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  27.35 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  24.8 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  27.58 
 
 		 440 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  24.04 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.24 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  26.09 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  26.04 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  26.04 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  26.04 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  26.04 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  26.04 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  25.82 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  26.21 
 
 		 622 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  25.67 
 
 		 444 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  24.72 
 
 		 450 aa  89.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  24.18 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  24.69 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  28.91 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  26.22 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  24.92 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  23.08 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  25.13 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  26.15 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  25.83 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  26.09 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>