More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2930 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  83 
 
 		 811 aa  1424    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  78.81 
 
 		 820 aa  1361    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  79.51 
 
 		 820 aa  1372    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  80.22 
 
 		 815 aa  1360    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  77.67 
 
 		 814 aa  1331    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  78.65 
 
 		 812 aa  1355    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  75.91 
 
 		 821 aa  1320    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  74.94 
 
 		 825 aa  1253    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  76.03 
 
 		 821 aa  1319    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  51.4 
 
 		 807 aa  797    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  79.26 
 
 		 823 aa  1349    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  79.26 
 
 		 823 aa  1347    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 810 aa  1661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  75.54 
 
 		 825 aa  1308    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  78.2 
 
 		 820 aa  1353    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  80.05 
 
 		 823 aa  1364    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  79.98 
 
 		 824 aa  1371    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 714 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 720 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 720 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 737 aa  156  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 748 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 748 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 711 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 776 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 742 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 749 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 742 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 738 aa  144  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 		 713 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 724 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 724 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 723 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 715 aa  131  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  22.06 
 
 		 707 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 720 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 720 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 		 711 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.81 
 
 		 724 aa  124  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 701 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 702 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 702 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  32.02 
 
 		 699 aa  121  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 708 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  22.96 
 
 		 708 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 719 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  22.45 
 
 		 703 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  22.62 
 
 		 709 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 795 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.99 
 
 		 713 aa  108  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  22.63 
 
 		 693 aa  107  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 701 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  23.16 
 
 		 753 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 701 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 810 aa  105  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.51 
 
 		 728 aa  104  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 797 aa  104  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 770 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 713 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 701 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  30.25 
 
 		 715 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 710 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 722 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 722 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 679 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 881 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 881 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 921 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 921 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 		 707 aa  100  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 881 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 701 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  33.93 
 
 		 678 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 701 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 882 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 726 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  37.25 
 
 		 710 aa  99.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 743 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 720 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 719 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 710 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 795 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 701 aa  98.2  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 815 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 693 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 693 aa  97.4  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 706 aa  97.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  36.26 
 
 		 721 aa  97.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 796 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 706 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.51 
 
 		 797 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 		 796 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.77 
 
 		 806 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>