171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1174 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 457 aa  899    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  31.06 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  32.03 
 
 		 473 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  31.88 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  32.47 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  30.07 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  30.16 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  31.6 
 
 		 517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  32.11 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 477 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  30.59 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 489 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  29.86 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  29.86 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  31.29 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  30.3 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  31.47 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  32.8 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  30.43 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 587 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  30.63 
 
 		 583 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.66 
 
 		 491 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  25.75 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  32.24 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  33.2 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.02 
 
 		 1496 aa  67  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.05 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1470 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  24.67 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  20.54 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  31.18 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 635 aa  57  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 439 aa  57  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  25.78 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.61 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.42 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 578 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  27.84 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 578 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  28.57 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  27.36 
 
 		 511 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.56 
 
 		 456 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.56 
 
 		 452 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>