More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6968 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  299  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.01 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  31.54 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  38.1 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.55 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  32.62 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.69 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.57 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  36.3 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.62 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.25 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.61 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.23 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.97 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.43 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.57 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.25 
 
 		 294 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.76 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.44 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.37 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.99 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.86 
 
 		 320 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  32.21 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.46 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.91 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.37 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  40 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  32.19 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  32.19 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  32.19 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  31.41 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  32.19 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  32.19 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.19 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  33.1 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.87 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.87 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.94 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  32.19 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.16 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  37.69 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.89 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.19 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.94 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  29.14 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.93 
 
 		 307 aa  67  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.06 
 
 		 297 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.08 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  30 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  34.48 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  30.82 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.99 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  34.97 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  30 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.97 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  41.86 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.43 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.28 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  34.01 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.66 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.66 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.08 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2106  UspA domain protein  23.65 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>