121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1016 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  100 
 
 		 338 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  68.05 
 
 		 338 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  67.46 
 
 		 338 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  45.56 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  48.49 
 
 		 341 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  47.73 
 
 		 359 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  45.05 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  44.48 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  42.51 
 
 		 342 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  41.12 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  48.19 
 
 		 200 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  54.14 
 
 		 147 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.69 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  30.47 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  29.47 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  29.15 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  28.15 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  27.81 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.28 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  27.44 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  27.45 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.28 
 
 		 344 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  26.67 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  27.48 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  27.12 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  27.15 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  29.78 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  26.47 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  29.92 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  27.63 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  25.75 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.2 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  23.62 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  23.99 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  29.92 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  24.23 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  22.41 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  29.52 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  24.14 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  27 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  25.86 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  25.86 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  28.1 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  28.1 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  21.99 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 		 228 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 		 228 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 182 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  28.18 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.12 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  24.49 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  27.43 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  24.01 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  24.43 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  23.81 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  27.82 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  22.76 
 
 		 388 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27.07 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  23.65 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  23.25 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  27.71 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  24.71 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  22.41 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  20.21 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  20.21 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  23.56 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  20.37 
 
 		 284 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  20.32 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  20.21 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  26.13 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  28.02 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.47 
 
 		 412 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.78 
 
 		 411 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.47 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.47 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  21.74 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  27.72 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  25.45 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.92 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  25.7 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  23.79 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 384 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 451 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  23.21 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>