More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1951 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  100 
 
 
430 aa  902  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.46207e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  100 
 
 
430 aa  902  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  67.75 
 
 
431 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  36.93 
 
 
388 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  34.71 
 
 
381 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  34.52 
 
 
401 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  34.26 
 
 
402 aa  185  1e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  33.33 
 
 
341 aa  176  1e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  30.02 
 
 
411 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  30.02 
 
 
411 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  30.02 
 
 
411 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.53071e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  29.4 
 
 
411 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  30.27 
 
 
428 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  5.30695e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  29.13 
 
 
426 aa  148  2e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  28.28 
 
 
428 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  28.64 
 
 
431 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  26.27 
 
 
446 aa  134  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  26.27 
 
 
430 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.95373e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  26.27 
 
 
446 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.84312e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  28.07 
 
 
398 aa  128  2e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  27.23 
 
 
412 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  30.61 
 
 
424 aa  122  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.39 
 
 
412 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  4.65357e-06  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  29.08 
 
 
393 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  27.3 
 
 
417 aa  109  8e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  33.58 
 
 
273 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.94 
 
 
375 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  27.05 
 
 
403 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  2.14757e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.38 
 
 
255 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.84 
 
 
435 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  3.73788e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.06 
 
 
386 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.19 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.19 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.2 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.19 
 
 
401 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.25813e-07  decreased coverage  8.56927e-08 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.29 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  3.81875e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.94 
 
 
407 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  3.56379e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  24.12 
 
 
407 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24.26 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  24.08 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.25151e-05  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  33.33 
 
 
190 aa  85.1  2e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  28.42 
 
 
390 aa  85.5  2e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.26 
 
 
392 aa  84.7  3e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  24.55 
 
 
471 aa  84  5e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  7.94278e-07  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  26.12 
 
 
292 aa  80.9  4e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  4.02051e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  21.66 
 
 
359 aa  79.7  9e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.03 
 
 
357 aa  79.7  1e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  25.73 
 
 
346 aa  79  2e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  23.44 
 
 
397 aa  79  2e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  26.13 
 
 
338 aa  78.6  2e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  24.11 
 
 
356 aa  79  2e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.35 
 
 
403 aa  75.9  1e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.68 
 
 
378 aa  72.8  1e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.32 
 
 
370 aa  70.9  4e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.32 
 
 
365 aa  71.2  4e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25.45 
 
 
506 aa  70.5  6e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.47 
 
 
414 aa  70.5  6e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.92 
 
 
389 aa  68.9  1e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.87 
 
 
443 aa  68.6  2e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  23.99 
 
 
404 aa  68.6  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1930  phage integrase  27.78 
 
 
193 aa  66.6  8e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.45 
 
 
391 aa  66.6  9e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.77 
 
 
390 aa  65.9  1e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  23.68 
 
 
404 aa  65.9  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.43 
 
 
377 aa  65.5  2e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  22.75 
 
 
396 aa  65.5  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.46 
 
 
379 aa  65.5  2e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  24.1 
 
 
293 aa  64.3  4e-09  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.89 
 
 
363 aa  63.9  5e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  24.24 
 
 
348 aa  63.9  6e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  28.57 
 
 
373 aa  63.5  7e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.51 
 
 
325 aa  63.2  8e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  24.7 
 
 
438 aa  62.8  1e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.7 
 
 
357 aa  62.4  1e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  25.09 
 
 
381 aa  61.6  2e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  21.99 
 
 
335 aa  61.6  2e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.71 
 
 
397 aa  61.6  2e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 
299 aa  62  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.9497e-06  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 
301 aa  61.2  4e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.8 
 
 
276 aa  60.5  5e-08  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25.17 
 
 
404 aa  60.8  5e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  21.02 
 
 
367 aa  59.7  9e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.32 
 
 
403 aa  59.7  9e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  24.65 
 
 
391 aa  59.3  1e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
299 aa  59.7  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 
299 aa  59.3  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 
299 aa  59.3  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
299 aa  58.9  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  21.87 
 
 
425 aa  58.5  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
299 aa  58.9  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.85052e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  23.06 
 
 
476 aa  58.2  3e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
299 aa  57.8  3e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.62 
 
 
477 aa  58.2  3e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 
299 aa  58.2  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 
299 aa  57.8  3e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.91393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.07 
 
 
369 aa  57.8  4e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  21.09 
 
 
376 aa  57.4  5e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  20.89 
 
 
451 aa  57  6e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 
304 aa  56.6  7e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.22 
 
 
404 aa  56.6  8e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>