More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0966 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  100 
 
 		 346 aa  717    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1253  integrase family protein  93.75 
 
 		 160 aa  288  7e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.101207  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  29.46 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  30.31 
 
 		 393 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.85 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  32.29 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  29.57 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  29.57 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  32.56 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.47 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  27.6 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  24.09 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  22.85 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.9 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  29.44 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  29.44 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  29.44 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  30.48 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  22.71 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  25.73 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  27.31 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.3 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.28 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.44 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.39 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.22 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.42 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  29.22 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  25.34 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  27.39 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.09 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  26.74 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  34.15 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.59 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  24.11 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  22.61 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.98 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  24.66 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  30.05 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.18 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.21 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  27.24 
 
 		 293 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.36 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  29.83 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.8 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  23.85 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.72 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.85 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.36 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  23.77 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.94 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.37 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.84 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.84 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.67 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  30.66 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  31.3 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.8 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  24.27 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.45 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  23.87 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.93 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  24.88 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  20.83 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  27.1 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  23.95 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  26.25 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  22.31 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  22.76 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  30.6 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  31.62 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  21.4 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  31.62 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.27 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  31.62 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.68 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.85 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.23 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  30.32 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.8 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>