20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1253 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1253  integrase family protein  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.101207  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  93.75 
 
 		 346 aa  288  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.34 
 
 		 392 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  32.33 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 397 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 407 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  30.89 
 
 		 407 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.34 
 
 		 393 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.06 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  30.94 
 
 		 420 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  24.4 
 
 		 431 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  29.51 
 
 		 391 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.13 
 
 		 471 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 413 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  28.26 
 
 		 445 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  23.35 
 
 		 395 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  25.37 
 
 		 391 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  25.37 
 
 		 387 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  28.68 
 
 		 395 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>