142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0032 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  100 
 
 
440 aa  904  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  34.03 
 
 
421 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  32.79 
 
 
422 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  34.06 
 
 
427 aa  217  3e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  31.78 
 
 
439 aa  214  3e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  29.51 
 
 
408 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.73 
 
 
454 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  28.04 
 
 
442 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.81 
 
 
403 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  27.14 
 
 
422 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  26.09 
 
 
423 aa  137  3e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.94 
 
 
430 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25.57 
 
 
406 aa  137  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  25.74 
 
 
452 aa  135  1e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.89729e-09  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  26.94 
 
 
445 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  24.73 
 
 
437 aa  120  5e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  23.21 
 
 
455 aa  120  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  26.89 
 
 
449 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  32.86 
 
 
482 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  38.76 
 
 
410 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  51.09 
 
 
203 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  23.53 
 
 
410 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  25.4 
 
 
769 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  26.79 
 
 
736 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  38.51 
 
 
478 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  28.95 
 
 
420 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  27.03 
 
 
577 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  25.63 
 
 
445 aa  85.9  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 
709 aa  81.6  2e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  27.39 
 
 
464 aa  80.1  7e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  23.78 
 
 
453 aa  78.6  2e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  31.65 
 
 
464 aa  75.1  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  29.76 
 
 
418 aa  72.8  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  41.49 
 
 
360 aa  70.9  4e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  27.84 
 
 
415 aa  69.3  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.54 
 
 
429 aa  69.3  1e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  29.65 
 
 
532 aa  67.8  4e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  27.6 
 
 
414 aa  66.6  8e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  31.62 
 
 
608 aa  66.6  8e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  27.98 
 
 
610 aa  65.9  2e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  25.53 
 
 
452 aa  62.4  1e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  31.03 
 
 
976 aa  61.2  3e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  39.33 
 
 
369 aa  59.3  1e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  29.17 
 
 
582 aa  58.2  3e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  31.48 
 
 
176 aa  57  6e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  35.29 
 
 
712 aa  54.3  4e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  24.62 
 
 
447 aa  53.9  6e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  36.67 
 
 
352 aa  52.8  1e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  35.56 
 
 
353 aa  52  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  23.12 
 
 
386 aa  51.2  3e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.62 
 
 
548 aa  51.2  4e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  51.02 
 
 
416 aa  50.4  6e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  48.94 
 
 
700 aa  50.1  7e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  46.3 
 
 
565 aa  50.1  8e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  51.06 
 
 
702 aa  50.1  8e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  4.97741e-05 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  53.19 
 
 
702 aa  49.7  9e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.83 
 
 
623 aa  50.1  9e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  51.06 
 
 
702 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  26.32 
 
 
601 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  21.11 
 
 
349 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  6.98714e-05 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  27.63 
 
 
513 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  47.27 
 
 
935 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  44.9 
 
 
891 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  44.68 
 
 
586 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  44.68 
 
 
1099 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  47.27 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  34.02 
 
 
619 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  34.41 
 
 
515 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  37.8 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  24.09 
 
 
368 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  42.86 
 
 
1074 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  37.7 
 
 
924 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  30 
 
 
670 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  43.1 
 
 
812 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  42 
 
 
1063 aa  47.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  37.7 
 
 
895 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  28.26 
 
 
369 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  42.86 
 
 
535 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.28 
 
 
1178 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  24.93 
 
 
567 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.33 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  44 
 
 
1125 aa  46.6  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  43.18 
 
 
561 aa  46.6  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  41.3 
 
 
458 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  32.11 
 
 
562 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  44.9 
 
 
669 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  38 
 
 
595 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  42 
 
 
555 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  35.21 
 
 
708 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  42.55 
 
 
912 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.9 
 
 
353 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  40 
 
 
728 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  33.33 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  28.97 
 
 
336 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  43.48 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  30.4 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  34.69 
 
 
1259 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  24.7 
 
 
519 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  40 
 
 
1093 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  36.62 
 
 
113 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>