More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0663 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 652 aa  1333    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  92.8 
 
 		 653 aa  1206    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  88.67 
 
 		 653 aa  1191    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  67.17 
 
 		 656 aa  895    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  69.36 
 
 		 665 aa  937    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  93.42 
 
 		 653 aa  1216    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  58.45 
 
 		 656 aa  775    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  89.13 
 
 		 653 aa  1184    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  89.13 
 
 		 653 aa  1187    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  92.5 
 
 		 653 aa  1207    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  88.36 
 
 		 653 aa  1192    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  62.14 
 
 		 659 aa  797    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  56.67 
 
 		 646 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  88.06 
 
 		 653 aa  1169    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  26.67 
 
 		 713 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 704 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 688 aa  173  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 704 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.23 
 
 		 666 aa  165  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 657 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 638 aa  144  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.65 
 
 		 706 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 656 aa  120  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 664 aa  120  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 700 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 700 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 700 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 700 aa  108  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 700 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  37.7 
 
 		 618 aa  104  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.11 
 
 		 700 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 700 aa  103  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 700 aa  103  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.11 
 
 		 700 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 812 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 633 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 711 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 776 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 667 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  37.81 
 
 		 681 aa  100  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.78 
 
 		 690 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.67 
 
 		 620 aa  99  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  28.38 
 
 		 650 aa  99  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 621 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 720 aa  97.1  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  23.76 
 
 		 690 aa  96.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.14 
 
 		 689 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.41 
 
 		 636 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 618 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 619 aa  96.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 715 aa  96.3  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 789 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.93 
 
 		 795 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 593 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 678 aa  95.5  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 703 aa  94.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 701 aa  95.1  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 634 aa  94.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 770 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.44 
 
 		 706 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 638 aa  94.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 		 710 aa  94.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 710 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 815 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.13 
 
 		 710 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.88 
 
 		 664 aa  93.6  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.76 
 
 		 619 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.09 
 
 		 721 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 621 aa  93.2  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.65 
 
 		 628 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.44 
 
 		 706 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.55 
 
 		 706 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  22.28 
 
 		 702 aa  93.2  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.49 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 821 aa  92  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.31 
 
 		 617 aa  92  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  42.22 
 
 		 751 aa  92  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 825 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.31 
 
 		 706 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 694 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  21.41 
 
 		 729 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 715 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 615 aa  90.5  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 689 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 729 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  21.94 
 
 		 716 aa  89  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 825 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 777 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 613 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 602 aa  89.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 777 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  21.15 
 
 		 729 aa  88.6  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 675 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 694 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 683 aa  88.6  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 817 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 704 aa  87.8  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>