103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0455 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 403 aa  818    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 403 aa  818    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  42.68 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  52.71 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  31.03 
 
 		 413 aa  189  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  37.82 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  37.82 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  26.79 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  32.35 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  51.43 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  27.94 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  29.98 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  46.1 
 
 		 159 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  25.71 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  30.32 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2471  type I restriction-modification system S subunit  32.2 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0091078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  32.32 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  26.91 
 
 		 437 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  27.73 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.03 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.07 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  34.78 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  31.15 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  92.8  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  30.43 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  25.93 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.67 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  30.81 
 
 		 463 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  25.27 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  29.15 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  20.05 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  30.24 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  28.52 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  24.5 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  22.12 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.2 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.1 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  23.64 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  32.31 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  28.19 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  25.42 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.47 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  24.84 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  27.72 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  23.6 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  25.98 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  24.31 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.66 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  26.32 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  32.28 
 
 		 799 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  27.32 
 
 		 183 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  23.12 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.08 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  25.64 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  25.64 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  29.19 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  26.03 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  29.15 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.71 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.41 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  23.5 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  22.53 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  23.76 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  24.17 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  22.2 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  29.93 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  27.18 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  23.83 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3120  hypothetical protein  21.83 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.239583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  24.62 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  26.57 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.55 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.73 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  24.65 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.96 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.47 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  24.79 
 
 		 562 aa  50.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  22.09 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  21.63 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  24.71 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.56 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  24.56 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0554  hypothetical protein  28.12 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0203297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  26.42 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.74 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  29.38 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  25.7 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  27.71 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  27.12 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  22.07 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  21.16 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.93 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  23.62 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  27.37 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  20.91 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.19 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>