19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0554 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  100 
 
 		 183 aa  269  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0203297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  50 
 
 		 407 aa  94  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  40.15 
 
 		 401 aa  93.6  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  39.39 
 
 		 417 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.64 
 
 		 400 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  37.19 
 
 		 432 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  36.36 
 
 		 418 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  38.1 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  33.64 
 
 		 425 aa  67.4  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  31.93 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  32.65 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  31.16 
 
 		 427 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  28.33 
 
 		 403 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  28.33 
 
 		 403 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  27.56 
 
 		 413 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  30.1 
 
 		 430 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  29.13 
 
 		 435 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>