More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2907 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  783    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  83.51 
 
 		 392 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  64.58 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  60 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  51.76 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  49.33 
 
 		 386 aa  349  6e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  46.79 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  44.71 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  41.95 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  43.92 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  42.22 
 
 		 377 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  41.69 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  41.69 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  43.31 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  46.58 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  45.55 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 		 380 aa  299  7e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  44.92 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  43.21 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  45.68 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 378 aa  285  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 369 aa  283  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  42.35 
 
 		 368 aa  277  3e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  43.05 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  41.26 
 
 		 370 aa  276  6e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  40.06 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  40.49 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  36.41 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  38.52 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.84 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  38.11 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  36.78 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  37.77 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  34.47 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  35.71 
 
 		 561 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 		 354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  34.76 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  35.2 
 
 		 769 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 496 aa  180  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 349 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 330 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.87 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.47 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 334 aa  166  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  33.88 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.51 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.83 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.87 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.11 
 
 		 422 aa  139  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.85 
 
 		 355 aa  136  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.9 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>