126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0477 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  69.33 
 
 		 473 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  70.07 
 
 		 489 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  70.29 
 
 		 489 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  71.36 
 
 		 489 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 517 aa  1052    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  70.62 
 
 		 493 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  69.47 
 
 		 467 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  70.62 
 
 		 489 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  70.62 
 
 		 489 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  70.09 
 
 		 465 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  70.62 
 
 		 473 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  70.02 
 
 		 463 aa  628  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  66.44 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  63.85 
 
 		 477 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  62.3 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  43.67 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  45.22 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  42.22 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  43.47 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  40.32 
 
 		 463 aa  321  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  39.91 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  31.44 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 452 aa  163  9e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  29.14 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  31.61 
 
 		 583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.14 
 
 		 491 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 471 aa  93.6  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  20.51 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 1496 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.27 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  22.37 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.34 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.84 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1470 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  26.27 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 523 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 443 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.51 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.85 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 525 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  22.18 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  19.29 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 516 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 425 aa  51.2  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 454 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.36 
 
 		 456 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  21.25 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 419 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.75 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 462 aa  50.1  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22.93 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.16 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.89 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2751  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 627 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 470 aa  47.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.5 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  21.45 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>