More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2213 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  100 
 
 		 656 aa  1298    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 1406 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 697 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.02 
 
 		 1764 aa  286  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  36.7 
 
 		 700 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  34.75 
 
 		 725 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.28 
 
 		 695 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  32.29 
 
 		 652 aa  240  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  38.39 
 
 		 889 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  29.66 
 
 		 669 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  36.54 
 
 		 542 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  30.58 
 
 		 663 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  29.37 
 
 		 762 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.37 
 
 		 762 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  32.27 
 
 		 648 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  32.81 
 
 		 637 aa  216  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 899 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  33.87 
 
 		 530 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  30.29 
 
 		 673 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  31.97 
 
 		 677 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.13 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  29.72 
 
 		 542 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  28.16 
 
 		 634 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 685 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  32.79 
 
 		 717 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 573 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  32.5 
 
 		 720 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  37.78 
 
 		 525 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  29.34 
 
 		 604 aa  167  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.47 
 
 		 578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  35.78 
 
 		 322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.91 
 
 		 546 aa  165  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  23.72 
 
 		 594 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  25.99 
 
 		 524 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  31.15 
 
 		 624 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  35.28 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.3 
 
 		 549 aa  151  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  30.46 
 
 		 531 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.41 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.71 
 
 		 636 aa  148  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  28.02 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  32.81 
 
 		 533 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  35.91 
 
 		 670 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  30.5 
 
 		 742 aa  143  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  32.18 
 
 		 488 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.51 
 
 		 548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 713 aa  130  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 502 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  23.03 
 
 		 514 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  22.25 
 
 		 482 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  31.63 
 
 		 519 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 494 aa  114  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  30.89 
 
 		 625 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  22.49 
 
 		 484 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  26.27 
 
 		 614 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  22.74 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 878 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 		 810 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.82 
 
 		 632 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 		 689 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  35 
 
 		 535 aa  89  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.98 
 
 		 875 aa  88.2  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 909 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 3035 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 681 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 602 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.23 
 
 		 626 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 3145 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 1737 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.4 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.27 
 
 		 725 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.1 
 
 		 816 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.32 
 
 		 865 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  27.47 
 
 		 626 aa  80.5  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 718 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 700 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  36.88 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.1 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.34 
 
 		 1694 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25 
 
 		 832 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1276 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 601 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.4 
 
 		 620 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 3172 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 824 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.11 
 
 		 764 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 594 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.96 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1450 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>