More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2312 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  40.5 
 
 		 1097 aa  762    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  100 
 
 		 1082 aa  2206    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  79 
 
 		 1090 aa  1769    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  32.44 
 
 		 1067 aa  486  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  26.33 
 
 		 1079 aa  327  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  27.36 
 
 		 1125 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  25.07 
 
 		 1084 aa  291  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  25.85 
 
 		 1075 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1059 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  28.8 
 
 		 1016 aa  283  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  24.71 
 
 		 1076 aa  283  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  26.94 
 
 		 1117 aa  282  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  27.01 
 
 		 1104 aa  277  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  27.55 
 
 		 1089 aa  264  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  25.54 
 
 		 1092 aa  251  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  25.2 
 
 		 1104 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  25.86 
 
 		 1097 aa  244  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  25.31 
 
 		 1093 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  25.04 
 
 		 1094 aa  240  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  29.62 
 
 		 1193 aa  239  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  25.29 
 
 		 1093 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  25.47 
 
 		 1093 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  25.31 
 
 		 1094 aa  229  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  25.82 
 
 		 1084 aa  221  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1051 aa  221  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  24.27 
 
 		 1094 aa  220  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  32.75 
 
 		 1167 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  24.94 
 
 		 1183 aa  216  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  25.52 
 
 		 1094 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  24.92 
 
 		 1094 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  25.27 
 
 		 1094 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  25.08 
 
 		 1094 aa  207  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  24.61 
 
 		 1094 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  34.11 
 
 		 1069 aa  175  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  26.84 
 
 		 1181 aa  174  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  30.2 
 
 		 1065 aa  168  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  32.55 
 
 		 1186 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  30.85 
 
 		 1107 aa  145  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  29.19 
 
 		 1147 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  29.47 
 
 		 1008 aa  139  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  30.77 
 
 		 482 aa  128  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.84 
 
 		 1059 aa  117  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  30.37 
 
 		 483 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.24 
 
 		 425 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  27.29 
 
 		 428 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  28.83 
 
 		 1031 aa  109  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  26.95 
 
 		 1066 aa  108  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.56 
 
 		 1005 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  26.58 
 
 		 1354 aa  105  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.96 
 
 		 1010 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  25.84 
 
 		 1484 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25.71 
 
 		 1081 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  36.63 
 
 		 567 aa  101  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25 
 
 		 1062 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.35 
 
 		 1069 aa  100  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  24.58 
 
 		 1062 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.31 
 
 		 717 aa  99.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.5 
 
 		 1071 aa  99  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  26.3 
 
 		 1067 aa  99  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  27.66 
 
 		 465 aa  99  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  25.06 
 
 		 1060 aa  98.6  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.37 
 
 		 1042 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  24.7 
 
 		 1062 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  25.69 
 
 		 427 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  26.13 
 
 		 389 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.4 
 
 		 1062 aa  96.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.48 
 
 		 572 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1065 aa  95.9  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  23.96 
 
 		 1062 aa  94.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.45 
 
 		 1040 aa  94.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1042 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  27.82 
 
 		 432 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.63 
 
 		 1062 aa  92.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  26.18 
 
 		 427 aa  92.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.87 
 
 		 1062 aa  92.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  28.65 
 
 		 452 aa  92  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  28.64 
 
 		 457 aa  91.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  27.68 
 
 		 1545 aa  89.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.58 
 
 		 1014 aa  88.6  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  23.63 
 
 		 1062 aa  88.6  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  23.63 
 
 		 1062 aa  88.6  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.38 
 
 		 1138 aa  88.6  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.15 
 
 		 1049 aa  88.2  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  27.68 
 
 		 1545 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.86 
 
 		 428 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  26.54 
 
 		 969 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.72 
 
 		 1078 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  39.64 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  39.64 
 
 		 434 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.4 
 
 		 429 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  28.81 
 
 		 435 aa  84  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.38 
 
 		 445 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  35.81 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.94 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  35.81 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.72 
 
 		 590 aa  81.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.43 
 
 		 427 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.28 
 
 		 397 aa  81.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  35.81 
 
 		 446 aa  80.9  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>