268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0056 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  100 
 
 		 606 aa  1245    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  30.16 
 
 		 902 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.81 
 
 		 986 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  30.74 
 
 		 901 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  33.25 
 
 		 934 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.84 
 
 		 902 aa  186  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  29.17 
 
 		 1097 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.1 
 
 		 1048 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  31.15 
 
 		 1255 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  33.1 
 
 		 650 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  29.62 
 
 		 797 aa  146  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  32.38 
 
 		 650 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  30.04 
 
 		 1408 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  31.38 
 
 		 754 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1275 aa  140  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.42 
 
 		 486 aa  140  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.8 
 
 		 611 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.97 
 
 		 636 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  34.38 
 
 		 622 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.86 
 
 		 1271 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  27.89 
 
 		 1077 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  34.03 
 
 		 619 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  32.46 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  33.68 
 
 		 622 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.69 
 
 		 629 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  27.52 
 
 		 466 aa  130  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.83 
 
 		 655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  29.7 
 
 		 1270 aa  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.46 
 
 		 636 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  33.22 
 
 		 651 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  29.06 
 
 		 1153 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.1 
 
 		 752 aa  124  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  28.01 
 
 		 1090 aa  123  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  29.37 
 
 		 1111 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  26.34 
 
 		 635 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.61 
 
 		 632 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1215 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  29.28 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.96 
 
 		 1428 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.17 
 
 		 633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  31.82 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1259 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  28.14 
 
 		 1082 aa  113  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1172 aa  113  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  29.9 
 
 		 1280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.05 
 
 		 633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  28.05 
 
 		 1196 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  29.27 
 
 		 716 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  27.95 
 
 		 1228 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1247 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1215 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.71 
 
 		 633 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.72 
 
 		 1324 aa  110  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1139 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1116 aa  110  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  28.87 
 
 		 1151 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.43 
 
 		 1250 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  27.84 
 
 		 1261 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  29.6 
 
 		 1457 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  25.17 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.37 
 
 		 633 aa  107  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1126 aa  107  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  28.02 
 
 		 1198 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  29 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  30.93 
 
 		 952 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.76 
 
 		 1099 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  28.1 
 
 		 1427 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.6 
 
 		 715 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1118 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  29.46 
 
 		 1143 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  29.46 
 
 		 1143 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.14 
 
 		 609 aa  100  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  28.87 
 
 		 1143 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.42 
 
 		 932 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  25.81 
 
 		 1163 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1121 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  31.15 
 
 		 941 aa  98.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1350 aa  98.2  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.08 
 
 		 1653 aa  97.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.46 
 
 		 1999 aa  96.3  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  27.54 
 
 		 1403 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.68 
 
 		 1038 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.91 
 
 		 769 aa  94.4  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  32.82 
 
 		 268 aa  94  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  28.77 
 
 		 916 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.37 
 
 		 922 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.65 
 
 		 925 aa  92  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  28.17 
 
 		 1585 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  28.17 
 
 		 1585 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  26.13 
 
 		 686 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.62 
 
 		 315 aa  90.1  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  26.62 
 
 		 464 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  27.91 
 
 		 659 aa  89.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1018 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  32.62 
 
 		 1041 aa  88.2  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  27.88 
 
 		 759 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.87 
 
 		 1203 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  24.2 
 
 		 1284 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  26.69 
 
 		 928 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  27.88 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>