More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3853 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  100 
 
 		 415 aa  843    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  47 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  46.93 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  45.7 
 
 		 407 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  44.72 
 
 		 407 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  44.53 
 
 		 409 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  43.7 
 
 		 411 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  45.45 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  43 
 
 		 440 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  43.17 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  40.62 
 
 		 445 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  39.95 
 
 		 423 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  37.02 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  39.95 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  40.1 
 
 		 418 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  42.03 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  37.84 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  40.56 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  39.33 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  39.24 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  35.12 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  40 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  39.95 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  35.19 
 
 		 431 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  40.92 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.51 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  38.23 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  40.53 
 
 		 430 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  36.36 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  38.7 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  38.35 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  38.7 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  39.05 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  38.18 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  37.05 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  38.34 
 
 		 426 aa  245  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  38.07 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  39.55 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  37.65 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  37.65 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  39.62 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  38.14 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  38.33 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  36.85 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  37.68 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  39.52 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  38.13 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  37.01 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.79 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  36.48 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  35.5 
 
 		 433 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  36.34 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  39.06 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  35.31 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  37.5 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  36.2 
 
 		 437 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  36.89 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  36.25 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  38.64 
 
 		 452 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  37.14 
 
 		 613 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  36.04 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  33.25 
 
 		 431 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  38.38 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  38.38 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  33.09 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  38.38 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  34.85 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  32.45 
 
 		 438 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  33.49 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  30.92 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  35.75 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.79 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  35.94 
 
 		 401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  29.49 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  34.05 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  33.75 
 
 		 468 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  32.35 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30.59 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.69 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  32.22 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  29.22 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.36 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  32.73 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  31.73 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  33.97 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl600  putative beta-lactamase  28.23 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  31.95 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  33.25 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  32.89 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  32.45 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  30.71 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  31.97 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  27.98 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  30.42 
 
 		 431 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  31.15 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  34.27 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  27.39 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  30.7 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  27.63 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>