More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00873 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  100 
 
 		 812 aa  1656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  57.92 
 
 		 843 aa  928    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  63.97 
 
 		 816 aa  1033    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  64.65 
 
 		 839 aa  1038    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  63.91 
 
 		 813 aa  1034    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  39.91 
 
 		 709 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  39.75 
 
 		 849 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  39.58 
 
 		 738 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  31.75 
 
 		 755 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 697 aa  301  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 758 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 751 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  30.18 
 
 		 733 aa  266  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 732 aa  267  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 726 aa  266  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 726 aa  266  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 726 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 746 aa  262  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  29.06 
 
 		 732 aa  262  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  30.98 
 
 		 771 aa  244  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 808 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 817 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  29.1 
 
 		 723 aa  231  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 809 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 808 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 745 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 745 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 704 aa  212  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 745 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 764 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 742 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  27.29 
 
 		 723 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 701 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 718 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 717 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 700 aa  197  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 721 aa  194  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  27.11 
 
 		 714 aa  194  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  25 
 
 		 721 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 725 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 723 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 739 aa  174  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 713 aa  171  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 698 aa  171  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 716 aa  170  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 723 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 716 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 723 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  26.73 
 
 		 704 aa  164  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.1 
 
 		 724 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  25.5 
 
 		 713 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 728 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 753 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.91 
 
 		 801 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  25.8 
 
 		 332 aa  94.4  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 812 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.38 
 
 		 833 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 792 aa  82  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 778 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  31.29 
 
 		 791 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 518 aa  78.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.82 
 
 		 859 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 802 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 828 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1020 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 883 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 828 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 847 aa  74.7  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  31.2 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 828 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 794 aa  74.3  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 701 aa  74.3  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 822 aa  73.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 815 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  34.86 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  22.96 
 
 		 659 aa  72  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 755 aa  71.6  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 828 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.78 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.78 
 
 		 797 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  22.93 
 
 		 694 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  29.08 
 
 		 799 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 806 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.98 
 
 		 721 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  24.53 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>