More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1596 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  67.81 
 
 		 241 aa  308  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  66.95 
 
 		 233 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  48.07 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  39.39 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.4 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  118  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  34.06 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  32.03 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  36.73 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  35.78 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  35.27 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  34.51 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.6 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  33.61 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  31.17 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  37.28 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  32.46 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.77 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  31.2 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  39.55 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.76 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.33 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  32.76 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 258 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.18 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31.6 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  33.18 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.17 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  32.92 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 272 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 288 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  34.68 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  31.72 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  31.82 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  32.61 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.3 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  29.52 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  33.62 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.39 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  33.74 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  32.13 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 337 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  31.34 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.28 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  31.28 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  34.6 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.95 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  32.59 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>