99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2652 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  100 
 
 		 813 aa  1641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  38.74 
 
 		 542 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  41.39 
 
 		 509 aa  336  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  60 
 
 		 272 aa  321  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  37.84 
 
 		 520 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  49.38 
 
 		 746 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  50 
 
 		 848 aa  266  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  52.77 
 
 		 275 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  47.48 
 
 		 278 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  45.72 
 
 		 277 aa  230  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  30.66 
 
 		 782 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  39.02 
 
 		 778 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  44.4 
 
 		 818 aa  181  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  42.8 
 
 		 271 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  27.33 
 
 		 517 aa  169  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  37.29 
 
 		 297 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  49.15 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00297  hypothetical protein  25 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  47.78 
 
 		 953 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  49 
 
 		 955 aa  148  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  47.06 
 
 		 950 aa  148  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.53 
 
 		 986 aa  148  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  48.77 
 
 		 958 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  48.77 
 
 		 958 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  44.73 
 
 		 953 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  47.14 
 
 		 955 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  47.58 
 
 		 950 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  36.3 
 
 		 621 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  36.3 
 
 		 354 aa  138  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  35.19 
 
 		 739 aa  138  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1580 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  37.15 
 
 		 1448 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1448 aa  134  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  32.59 
 
 		 833 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  37.37 
 
 		 357 aa  130  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1495 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  35.31 
 
 		 744 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  36.18 
 
 		 736 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  33.75 
 
 		 1255 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  35.14 
 
 		 326 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  43.48 
 
 		 368 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  34.8 
 
 		 303 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.06 
 
 		 866 aa  115  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  26.52 
 
 		 408 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  32.99 
 
 		 326 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  26.67 
 
 		 411 aa  108  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  27.52 
 
 		 357 aa  107  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  34.34 
 
 		 1557 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.16 
 
 		 678 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.69 
 
 		 681 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.81 
 
 		 681 aa  106  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  32.57 
 
 		 1389 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  27.67 
 
 		 430 aa  105  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1077 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  35.64 
 
 		 775 aa  104  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  36.71 
 
 		 338 aa  102  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  36.61 
 
 		 890 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  35.59 
 
 		 775 aa  100  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  36.07 
 
 		 890 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  35.37 
 
 		 777 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  32.11 
 
 		 777 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  32.11 
 
 		 777 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  35.43 
 
 		 777 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  47.83 
 
 		 128 aa  95.5  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  32.75 
 
 		 523 aa  94.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  32.11 
 
 		 777 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  26.17 
 
 		 458 aa  93.2  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  34.5 
 
 		 896 aa  91.3  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  32.35 
 
 		 776 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  22.48 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  36.26 
 
 		 899 aa  84.3  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  34.64 
 
 		 878 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  33.52 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  23.01 
 
 		 815 aa  80.9  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  23.12 
 
 		 458 aa  80.5  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  33.46 
 
 		 835 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  30.43 
 
 		 895 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  32.73 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  32.73 
 
 		 763 aa  74.3  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  39.55 
 
 		 929 aa  73.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  24.22 
 
 		 848 aa  73.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  31.64 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  31.64 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  31.07 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  24.09 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  33.15 
 
 		 620 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  31.84 
 
 		 644 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  34.48 
 
 		 621 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3216  hypothetical protein  20.85 
 
 		 655 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000265804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  29.51 
 
 		 637 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  35.37 
 
 		 621 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  27.7 
 
 		 542 aa  54.3  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  23.11 
 
 		 947 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  37.5 
 
 		 269 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  31.58 
 
 		 328 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  29.17 
 
 		 616 aa  48.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  25.13 
 
 		 718 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2188  hypothetical protein  31.05 
 
 		 733 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>