More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1344 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  340  7e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  33.94 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  36 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  27.74 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  29.14 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>