More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0049 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  53.33 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  52.73 
 
 		 164 aa  170  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  52.47 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  48.15 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  51.5 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  49.17 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  48.26 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  49.09 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  48.02 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  46.71 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  41.11 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  44.69 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  42.58 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  45.96 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  44.85 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.17 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.37 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  41.72 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  45.4 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.86 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  41.5 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  41.67 
 
 		 187 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  41.67 
 
 		 187 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  45.4 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  49.65 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  44.79 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.69 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  43.03 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  42.94 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  40.25 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  46.15 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  43.75 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  45.1 
 
 		 173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  47.89 
 
 		 164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  39.46 
 
 		 187 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  44 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  39.46 
 
 		 187 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.59 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  48.97 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  45.7 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  39.75 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  39.75 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  39.62 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  39.62 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  40.76 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  40.76 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  40.83 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44.37 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  40.24 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  45.03 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  45.03 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  46.58 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  42.01 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  39.18 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  40.7 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  38.64 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  39.88 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1026  peptide deformylase  43.12 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000768351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  44.65 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  45.03 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.12 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.12 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  40.37 
 
 		 203 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  45.16 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  41.01 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  45.03 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  39.13 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  43.21 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  40.24 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  40.38 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  40.85 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  43.71 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  43.71 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  42.46 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  40.78 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  36.53 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.82 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.78 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  40.24 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  39.05 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  43.21 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  39.41 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.82 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  41.48 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  41.07 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  40.82 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  42.76 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  40.45 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  39.64 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  39.43 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  39.13 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  36.53 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  40.12 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  39.75 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  37.89 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  39.43 
 
 		 185 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>