More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0596 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  77.03 
 
 		 688 aa  1114    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  54.37 
 
 		 676 aa  745    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  56.71 
 
 		 684 aa  791    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  62.17 
 
 		 726 aa  850    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  56.96 
 
 		 686 aa  795    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  61.48 
 
 		 745 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  61.48 
 
 		 745 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  61.79 
 
 		 749 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  59.51 
 
 		 710 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 710 aa  1458    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  55.4 
 
 		 725 aa  754    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  60.09 
 
 		 710 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  58.54 
 
 		 698 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  62.06 
 
 		 753 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  61.69 
 
 		 713 aa  811    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  59.45 
 
 		 681 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  54.22 
 
 		 676 aa  743    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  61.23 
 
 		 687 aa  799    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  77.18 
 
 		 688 aa  1109    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  53.86 
 
 		 724 aa  732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  57.74 
 
 		 669 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  61.48 
 
 		 745 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  59.51 
 
 		 710 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  61.75 
 
 		 745 aa  811    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  48.24 
 
 		 691 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  77.62 
 
 		 688 aa  1118    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  60.92 
 
 		 709 aa  797    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  61.79 
 
 		 749 aa  809    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  57.53 
 
 		 687 aa  778    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  71.35 
 
 		 723 aa  1045    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  77.26 
 
 		 688 aa  1108    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  59.51 
 
 		 710 aa  788    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  72.61 
 
 		 719 aa  1048    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  59.45 
 
 		 681 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  46.03 
 
 		 686 aa  581  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.65 
 
 		 662 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  41.25 
 
 		 667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  41.7 
 
 		 661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  38.08 
 
 		 663 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  39.64 
 
 		 668 aa  425  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  39.57 
 
 		 668 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  38.01 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  39.26 
 
 		 668 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  33.43 
 
 		 695 aa  319  9e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 672 aa  300  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 		 665 aa  280  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 697 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 699 aa  221  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 681 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 668 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.79 
 
 		 699 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 702 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 760 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 702 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 702 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 768 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 661 aa  138  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 698 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 685 aa  124  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 716 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 673 aa  110  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 793 aa  108  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 684 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 696 aa  106  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 685 aa  103  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 705 aa  99.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 718 aa  98.6  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 766 aa  96.3  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 767 aa  92.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 780 aa  90.9  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 729 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.04 
 
 		 775 aa  84.7  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  22.63 
 
 		 701 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 713 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 750 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.94 
 
 		 775 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.12 
 
 		 867 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  32.98 
 
 		 625 aa  78.6  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 705 aa  77  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 708 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 713 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 713 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  49.25 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 680 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 682 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 685 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 744 aa  73.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  22.31 
 
 		 708 aa  72  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  23.79 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  21.14 
 
 		 714 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.73 
 
 		 861 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  22.58 
 
 		 685 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  22.83 
 
 		 746 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 749 aa  68.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  22.79 
 
 		 746 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.07 
 
 		 750 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 741 aa  67  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>