More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1260 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 289 aa  555  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.447417 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1879  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  72.66 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000550299  normal  0.675265 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0864  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  69.07 
 
 		 291 aa  394  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1412  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  72.32 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.256157  normal  0.274347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.92 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.58 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.42 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.33 
 
 		 476 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40.67 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.29 
 
 		 500 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.54 
 
 		 473 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.23 
 
 		 475 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  41.04 
 
 		 485 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40 
 
 		 481 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  41.25 
 
 		 403 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  42.02 
 
 		 396 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.38 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  39.35 
 
 		 498 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  39.77 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  38.55 
 
 		 462 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.87 
 
 		 464 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  39.58 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  39.75 
 
 		 382 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  41.25 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.55 
 
 		 466 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  41.63 
 
 		 485 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.68 
 
 		 478 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  37.55 
 
 		 476 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.23 
 
 		 461 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.47 
 
 		 398 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.42 
 
 		 385 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.87 
 
 		 457 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.59 
 
 		 452 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  40.86 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.11 
 
 		 475 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.97 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.2 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.34 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  35.59 
 
 		 389 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.92 
 
 		 384 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.48 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.43 
 
 		 453 aa  166  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.58 
 
 		 474 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.3 
 
 		 480 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.82 
 
 		 511 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.15 
 
 		 396 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.63 
 
 		 366 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.48 
 
 		 511 aa  165  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  41.67 
 
 		 379 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.69 
 
 		 398 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.18 
 
 		 472 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  36.13 
 
 		 453 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  36.8 
 
 		 505 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  39.18 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.77 
 
 		 513 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.2 
 
 		 476 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.97 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.6 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.82 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  40.94 
 
 		 524 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.17 
 
 		 502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38.11 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  38.13 
 
 		 403 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  36.8 
 
 		 502 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  38.52 
 
 		 407 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  36.4 
 
 		 507 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.38 
 
 		 412 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.25 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  38.52 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  37.1 
 
 		 372 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  40.37 
 
 		 498 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.54 
 
 		 502 aa  162  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.75 
 
 		 502 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  38.13 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.7 
 
 		 477 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.7 
 
 		 477 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.08 
 
 		 476 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.75 
 
 		 502 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.13 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.75 
 
 		 485 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.75 
 
 		 502 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.75 
 
 		 502 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.75 
 
 		 502 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.75 
 
 		 461 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  39.49 
 
 		 525 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  37.74 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.13 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  41.8 
 
 		 469 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  40.07 
 
 		 473 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  39.7 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.74 
 
 		 476 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.01 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  38.2 
 
 		 508 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.38 
 
 		 485 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  38.18 
 
 		 411 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 		 401 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 		 401 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  37.74 
 
 		 401 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  37.91 
 
 		 508 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  37.35 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>