More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0356 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  62.68 
 
 
702 aa  827  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  4.97741e-05 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  100 
 
 
700 aa  1337  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  60.4 
 
 
702 aa  827  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  66.95 
 
 
702 aa  840  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  32.06 
 
 
804 aa  151  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.76 
 
 
858 aa  147  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  23.1 
 
 
693 aa  134  8e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.72 
 
 
891 aa  120  8e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.56641e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 
790 aa  108  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
795 aa  103  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.6 
 
 
926 aa  101  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  27.79 
 
 
795 aa  99.4  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  29.01 
 
 
1061 aa  97.4  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.24 
 
 
935 aa  96.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.56 
 
 
864 aa  92.8  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.47 
 
 
902 aa  90.5  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  24.77 
 
 
784 aa  85.9  2e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  24.04 
 
 
993 aa  82.4  2e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  26.59 
 
 
891 aa  82.8  2e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.65 
 
 
789 aa  83.2  2e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  22.97 
 
 
1019 aa  80.5  1e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 
1191 aa  79.3  2e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 
994 aa  79.7  2e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  25.69 
 
 
1125 aa  78.6  3e-13  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 
993 aa  77.4  9e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  27.22 
 
 
993 aa  75.9  2e-12  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  28.32 
 
 
1016 aa  75.9  3e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25.25 
 
 
924 aa  75.5  3e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  26.95 
 
 
1021 aa  74.7  5e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  30.86 
 
 
895 aa  74.3  6e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25.19 
 
 
1074 aa  73.9  1e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  28 
 
 
1008 aa  71.2  5e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.38 
 
 
1019 aa  70.5  1e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  28.33 
 
 
1057 aa  70.1  1e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  26.5 
 
 
794 aa  68.6  4e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 
812 aa  68.6  4e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  24.58 
 
 
1189 aa  67  1e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  28.3 
 
 
888 aa  66.6  1e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  27.27 
 
 
1003 aa  67  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  32.35 
 
 
1076 aa  66.2  2e-09  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.16 
 
 
978 aa  66.6  2e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.06 
 
 
724 aa  65.9  2e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.88 
 
 
890 aa  65.9  3e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  25.47 
 
 
1031 aa  65.1  4e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  1.02622e-07 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  21.71 
 
 
802 aa  64.3  8e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  26.48 
 
 
805 aa  63.5  1e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  24.72 
 
 
483 aa  62.8  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  21.51 
 
 
1146 aa  62.4  3e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  5.00177e-06 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  23.44 
 
 
984 aa  61.6  5e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.65 
 
 
814 aa  60.5  1e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.66162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1196 aa  60.1  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  33.08 
 
 
922 aa  60.5  1e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.17 
 
 
859 aa  59.7  2e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 
1181 aa  59.3  2e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.41 
 
 
1007 aa  59.7  2e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.7 
 
 
1108 aa  59.7  2e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  24.65 
 
 
1114 aa  58.9  3e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  25 
 
 
1007 aa  58.5  4e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  26.23 
 
 
953 aa  58.2  5e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
238 aa  58.2  6e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  43.48 
 
 
302 aa  57.8  7e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.51 
 
 
961 aa  57.8  7e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  25.16 
 
 
950 aa  57.8  7e-07  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  43.48 
 
 
302 aa  57.8  7e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  33.14 
 
 
986 aa  57.4  8e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  37.38 
 
 
1190 aa  57.8  8e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 
1188 aa  57  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 
1188 aa  57  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
302 aa  56.6  1e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.39 
 
 
1177 aa  57  1e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.31 
 
 
813 aa  56.6  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  40 
 
 
238 aa  56.6  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  23.44 
 
 
859 aa  56.2  2e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  1.09294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.81 
 
 
1147 aa  56.2  2e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  39.13 
 
 
301 aa  55.8  2e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  20.09 
 
 
741 aa  56.2  2e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  24.75 
 
 
987 aa  56.6  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  43.48 
 
 
302 aa  56.6  2e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  35.65 
 
 
1189 aa  56.2  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  26.32 
 
 
1011 aa  56.6  2e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  35.65 
 
 
1189 aa  55.8  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  35.65 
 
 
1189 aa  55.8  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.9019e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  34.58 
 
 
1198 aa  55.5  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  34.78 
 
 
1189 aa  55.5  3e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  40.51 
 
 
244 aa  55.8  3e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0659  cell division ATP-binding protein FtsE  40.62 
 
 
248 aa  55.5  3e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.51977e-08  normal  0.070101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1205  cell division ATP-binding protein FtsE  42.19 
 
 
248 aa  55.8  3e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  40.45 
 
 
237 aa  55.8  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.09 
 
 
1146 aa  55.5  3e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
237 aa  55.8  3e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  34.78 
 
 
1189 aa  55.5  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.18533e-18 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  26.42 
 
 
677 aa  55.8  3e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  39.13 
 
 
308 aa  55.1  4e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.23 
 
 
1038 aa  55.5  4e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  35.37 
 
 
339 aa  55.5  4e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  34.58 
 
 
1198 aa  55.1  4e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  34.78 
 
 
1189 aa  55.1  4e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
237 aa  55.1  4e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  34.78 
 
 
1189 aa  55.1  5e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  34.78 
 
 
1189 aa  55.1  5e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>