More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2992 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 548 aa  1126    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 1406 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.08 
 
 		 1764 aa  197  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.41 
 
 		 637 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.26 
 
 		 725 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.85 
 
 		 695 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  29.23 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 685 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 697 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  27.9 
 
 		 546 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 713 aa  151  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.2 
 
 		 530 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  27.05 
 
 		 578 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  28.67 
 
 		 536 aa  148  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  25.9 
 
 		 652 aa  147  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  27.07 
 
 		 673 aa  147  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 530 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.86 
 
 		 762 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.86 
 
 		 762 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  26.53 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  28.89 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  27.59 
 
 		 648 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  27.34 
 
 		 889 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 899 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  27.51 
 
 		 656 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  25.44 
 
 		 542 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  27.68 
 
 		 532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  25.78 
 
 		 669 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  24.54 
 
 		 720 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  26.34 
 
 		 634 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.17 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  24.2 
 
 		 717 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  24.76 
 
 		 677 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  29.77 
 
 		 663 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  25.77 
 
 		 700 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 573 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  28.26 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  26.9 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 502 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  24.56 
 
 		 488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  27.94 
 
 		 482 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  27.35 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.8 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  25.41 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  23.36 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  28.77 
 
 		 670 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  27.86 
 
 		 614 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  25.24 
 
 		 742 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.25 
 
 		 549 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  26.26 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  28.33 
 
 		 624 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  23.04 
 
 		 636 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  27.78 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  27.94 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  23.39 
 
 		 625 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  32.42 
 
 		 594 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 878 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  33.08 
 
 		 837 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.08 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1676 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 718 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.08 
 
 		 887 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.96 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 750 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 739 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.82 
 
 		 810 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 935 aa  69.3  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.69 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.04 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 3301 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.06 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 909 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 3172 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 200 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 3145 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1827 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  34.23 
 
 		 622 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  32.31 
 
 		 936 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  35.14 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 1094 aa  64.3  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 766 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 955 aa  63.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 708 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>