More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2648 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_2648  predicted protein  100 
 
 
326 aa  671    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  62.03 
 
 
592 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76845 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  60.76 
 
 
592 aa  411  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  61.37 
 
 
695 aa  393  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31385  predicted protein  50.31 
 
 
462 aa  349  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000357166  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12783  predicted protein  48.96 
 
 
363 aa  311  7.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_13512  predicted protein  69.48 
 
 
230 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186669  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13210  predicted protein  69.48 
 
 
230 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00422519 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04330  cell division control protein, putative  44.51 
 
 
525 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00814  cell division cycle protein Cdc20, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14730)  43.95 
 
 
618 aa  256  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  38.25 
 
 
606 aa  239  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57298  predicted protein  30.5 
 
 
457 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.09 
 
 
919 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.5 
 
 
947 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.22 
 
 
1652 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.51 
 
 
696 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.37 
 
 
698 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.04 
 
 
1443 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 
1163 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
1363 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19210  predicted protein  80 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.103438  hitchhiker  0.00628492 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17898  predicted protein  80 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.72 
 
 
1523 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
1557 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.48 
 
 
1831 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.88 
 
 
664 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 
1760 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 
1411 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.95 
 
 
596 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
1236 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.8 
 
 
930 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.78 
 
 
778 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 
464 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.91 
 
 
1247 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.8 
 
 
1193 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.63 
 
 
1364 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  27.73 
 
 
516 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.82 
 
 
677 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 
1211 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.56 
 
 
1454 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.16 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45416  predicted protein  28.25 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.83 
 
 
1399 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.02 
 
 
1217 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.94 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.64 
 
 
1481 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 
1789 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.89 
 
 
682 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.28 
 
 
676 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  29.53 
 
 
774 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.51 
 
 
1188 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.4 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.48 
 
 
1510 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.09 
 
 
1357 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.31 
 
 
1868 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  26.41 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.18 
 
 
1221 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.87 
 
 
737 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.25 
 
 
564 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 
1240 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.62 
 
 
842 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.85 
 
 
1901 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  27.05 
 
 
565 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.94 
 
 
740 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.05 
 
 
1858 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.19 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  32.12 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.36 
 
 
630 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 
1190 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.97 
 
 
1344 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.91 
 
 
1553 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 
1807 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26 
 
 
1196 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  27.34 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  26.69 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  28.85 
 
 
1097 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.05 
 
 
733 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 
1348 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  22.04 
 
 
657 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  31.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.88 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  31.48 
 
 
405 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.34 
 
 
742 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.88 
 
 
924 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.67 
 
 
1484 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.96 
 
 
1686 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  31.71 
 
 
589 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 
1474 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.1 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 
1711 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.49 
 
 
1416 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.89 
 
 
1242 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  23.51 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.48 
 
 
574 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  26.98 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
577 aa  66.2  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
1213 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49403  predicted protein  27.36 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.27 
 
 
728 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>