More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13093 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  100 
 
 		 495 aa  1028    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  49.8 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  45.85 
 
 		 663 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  45.4 
 
 		 1326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  43.44 
 
 		 1414 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  42.98 
 
 		 956 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  42.89 
 
 		 1222 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  42.53 
 
 		 1111 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  42.2 
 
 		 1096 aa  365  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  39.31 
 
 		 1566 aa  360  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  42.37 
 
 		 1517 aa  360  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  40.37 
 
 		 1407 aa  359  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  41.23 
 
 		 1519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  40.9 
 
 		 1259 aa  356  5e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  41.15 
 
 		 589 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  42.62 
 
 		 1431 aa  353  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  40.76 
 
 		 995 aa  351  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54310  predicted protein  44.72 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  40.35 
 
 		 970 aa  346  6e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  42.12 
 
 		 522 aa  346  6e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  40.8 
 
 		 1023 aa  344  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  42.54 
 
 		 860 aa  336  7e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  38.93 
 
 		 1558 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  38.48 
 
 		 1443 aa  325  8.000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  39.33 
 
 		 509 aa  325  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  35.47 
 
 		 926 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16250  predicted protein  35.91 
 
 		 1156 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  32.63 
 
 		 1769 aa  243  7e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  33.47 
 
 		 711 aa  242  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  33.58 
 
 		 1107 aa  236  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  30.67 
 
 		 939 aa  236  9e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  33.08 
 
 		 1848 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.91 
 
 		 621 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  35.07 
 
 		 663 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  32.18 
 
 		 1093 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  33.06 
 
 		 991 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  34.24 
 
 		 773 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 1403 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 1108 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  29.33 
 
 		 1193 aa  227  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  31.24 
 
 		 1904 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  31.88 
 
 		 985 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  30.67 
 
 		 609 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 		 1069 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 		 876 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  31.18 
 
 		 1901 aa  223  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  34.23 
 
 		 1071 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  30.75 
 
 		 1161 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.13 
 
 		 1181 aa  223  8e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1068 aa  223  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.26 
 
 		 1091 aa  223  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 		 1082 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.38 
 
 		 1134 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 1112 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  32.3 
 
 		 1362 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  29.77 
 
 		 1067 aa  220  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  32.64 
 
 		 777 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1088 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  32.8 
 
 		 1125 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  32.64 
 
 		 1080 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1088 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  31.96 
 
 		 1070 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  32 
 
 		 1062 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  31.4 
 
 		 1159 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.87 
 
 		 1386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  33.12 
 
 		 1032 aa  217  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 1021 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.53 
 
 		 1227 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  32.58 
 
 		 1068 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 1105 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  33.2 
 
 		 1068 aa  216  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 1068 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 1104 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  31.9 
 
 		 1082 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  32.29 
 
 		 666 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  31.75 
 
 		 1082 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  31.82 
 
 		 872 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  31.95 
 
 		 1178 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  32.02 
 
 		 648 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 1120 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  33.74 
 
 		 1141 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 		 1055 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.64 
 
 		 1100 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  31.82 
 
 		 1120 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  31.71 
 
 		 1072 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  32.64 
 
 		 1077 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.25 
 
 		 1087 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.37 
 
 		 1250 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  31.55 
 
 		 1082 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  30.5 
 
 		 980 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  31.62 
 
 		 1120 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 1105 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  32.02 
 
 		 1084 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 1073 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  32.3 
 
 		 1088 aa  208  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 		 1073 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  31.5 
 
 		 1284 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  32.92 
 
 		 1126 aa  207  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  31.65 
 
 		 1086 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 1113 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>