More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1855 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 544 aa  1103    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  39.08 
 
 		 535 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  37.09 
 
 		 528 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 		 567 aa  340  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  40.92 
 
 		 507 aa  339  9e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  36.33 
 
 		 525 aa  333  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  34.98 
 
 		 544 aa  326  6e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  37.38 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 575 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  37.02 
 
 		 526 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 		 552 aa  306  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 		 556 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  34.34 
 
 		 560 aa  262  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 547 aa  257  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  37.53 
 
 		 535 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  37 
 
 		 555 aa  230  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  32.85 
 
 		 564 aa  225  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 		 556 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  36.58 
 
 		 551 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  32.85 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.53 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  33.59 
 
 		 540 aa  212  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  36.69 
 
 		 551 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  31.74 
 
 		 549 aa  211  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  30.76 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 565 aa  206  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  31.04 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  32.33 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  30.86 
 
 		 569 aa  192  9e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.09 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  32.84 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  40.19 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.44 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  32.36 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  35.95 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  33.5 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.75 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  32.98 
 
 		 582 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  31.59 
 
 		 550 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  33.88 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 550 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 441 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  28.19 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  34.13 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.56 
 
 		 444 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  31.73 
 
 		 397 aa  179  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.96 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  32.45 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  35.13 
 
 		 400 aa  177  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 461 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 456 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  30.89 
 
 		 496 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  30.89 
 
 		 496 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  34.13 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  33.74 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  33.23 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  33.02 
 
 		 418 aa  174  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  31.83 
 
 		 554 aa  174  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  34.91 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  33.87 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  32.36 
 
 		 491 aa  173  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  32.84 
 
 		 430 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  32.84 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  33.74 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  34.85 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  33.76 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.27 
 
 		 434 aa  171  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  34.04 
 
 		 479 aa  170  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  33.74 
 
 		 478 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  34.5 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  34.45 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  34.08 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  29.83 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 		 413 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  34.39 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  34.45 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  34.45 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  31.87 
 
 		 419 aa  169  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  33.12 
 
 		 494 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  32.57 
 
 		 377 aa  169  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  36.42 
 
 		 426 aa  169  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>