More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0179 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  100 
 
 		 388 aa  787    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  59.01 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  46.02 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.8 
 
 		 342 aa  285  9e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  54.29 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  52.11 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  52.03 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  52.11 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  58.08 
 
 		 359 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  49.66 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.03 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.08 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  49.29 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  55.51 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.95 
 
 		 362 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  43.68 
 
 		 364 aa  272  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  40.17 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.55 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1739  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.74 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.11345  hitchhiker  0.00063526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1524  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.74 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1631  ABC transporter related  52.74 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  54.43 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  54.89 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.91 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.61 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.98 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  49.01 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  50.84 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.76 
 
 		 354 aa  269  8e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  56.09 
 
 		 384 aa  269  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  52.54 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.58 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.53 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46.2 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  54.69 
 
 		 350 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.48 
 
 		 353 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  49.28 
 
 		 352 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  41.67 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.9 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.21 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.77 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  50.82 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  53.11 
 
 		 331 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  51.49 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  51.82 
 
 		 333 aa  266  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  42.65 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  50.21 
 
 		 353 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  48.77 
 
 		 362 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  48.24 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  45.35 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  44.76 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.34 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.91 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.77 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  41.09 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  53.56 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.98 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  53.07 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  43.14 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  47.81 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  42.18 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  54.8 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  51.04 
 
 		 342 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  50.64 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 367 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  52.92 
 
 		 329 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  50.43 
 
 		 369 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.65 
 
 		 347 aa  262  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  42.2 
 
 		 363 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  50.2 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  53.07 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  52.92 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  44.75 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  41.46 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  50.82 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.1 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  44.98 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  39.49 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.24 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  48.81 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.82 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.19 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.21 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>