More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1631 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1524  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 359 aa  737    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1631  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  737    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1739  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.72 
 
 		 359 aa  735    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.11345  hitchhiker  0.00063526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  50.56 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 357 aa  348  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  47.5 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  50.29 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  50.41 
 
 		 361 aa  345  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  51.75 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  49.17 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  49.59 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  46.58 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.56 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  50.28 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  49.03 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 361 aa  341  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  48.76 
 
 		 369 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.18 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  49.04 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  49.31 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  50.94 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  49.86 
 
 		 338 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  49.17 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  48.48 
 
 		 368 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  48.48 
 
 		 368 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  49.31 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  50.7 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  47.5 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  50.94 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  48.74 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  49.02 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  48.32 
 
 		 351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 		 364 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.2 
 
 		 366 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  50 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  50 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  46.38 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 364 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  49.73 
 
 		 385 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  47.37 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  52.85 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  49.45 
 
 		 369 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  47.19 
 
 		 338 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  49.17 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  46.34 
 
 		 370 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  47.11 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  48.19 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  48.89 
 
 		 369 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  48.2 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  49.3 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  49.72 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.61 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  47.51 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 335 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  57.49 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.82 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  49.44 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  45.4 
 
 		 371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  47.73 
 
 		 357 aa  329  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  48.58 
 
 		 331 aa  329  6e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  49.44 
 
 		 333 aa  329  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 379 aa  328  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 370 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  48.45 
 
 		 364 aa  328  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  46.78 
 
 		 362 aa  328  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  47.65 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  47.93 
 
 		 368 aa  328  9e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  48.48 
 
 		 359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.03 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  52.87 
 
 		 366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  46.63 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.65 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.53 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  49.22 
 
 		 384 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.02 
 
 		 367 aa  326  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  48.87 
 
 		 355 aa  327  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  47.75 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.53 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.36 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.02 
 
 		 367 aa  326  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.38 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  47.21 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.58 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  49.15 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.78 
 
 		 369 aa  325  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  48.49 
 
 		 357 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>