More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0071 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  45.07 
 
 		 835 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  48.15 
 
 		 843 aa  635  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  40.26 
 
 		 861 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 844 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  29.23 
 
 		 858 aa  288  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 844 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  29.25 
 
 		 843 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  29.32 
 
 		 832 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  29.63 
 
 		 870 aa  274  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  30.91 
 
 		 860 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 861 aa  268  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  27.67 
 
 		 849 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 847 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  29.01 
 
 		 848 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 849 aa  258  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 		 833 aa  256  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 		 832 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 847 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  28.54 
 
 		 862 aa  251  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  30.57 
 
 		 863 aa  251  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 		 856 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 		 840 aa  249  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.89 
 
 		 835 aa  249  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  30.78 
 
 		 869 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  31.12 
 
 		 831 aa  248  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.45 
 
 		 871 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  30.37 
 
 		 871 aa  243  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.49 
 
 		 832 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  31.38 
 
 		 831 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.26 
 
 		 829 aa  240  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 		 863 aa  238  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  29.13 
 
 		 858 aa  237  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  28.86 
 
 		 835 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.34 
 
 		 871 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.34 
 
 		 871 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 935 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  26.79 
 
 		 864 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 849 aa  233  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  28.41 
 
 		 860 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  29.3 
 
 		 834 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  28.7 
 
 		 863 aa  232  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.7 
 
 		 871 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  26.99 
 
 		 851 aa  230  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  29.45 
 
 		 871 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  28.59 
 
 		 844 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  26.65 
 
 		 856 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  31.21 
 
 		 874 aa  228  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.9 
 
 		 869 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 		 840 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  27.06 
 
 		 852 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  30.14 
 
 		 851 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  29.63 
 
 		 869 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.24 
 
 		 840 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 		 830 aa  218  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  27.13 
 
 		 858 aa  218  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.77 
 
 		 804 aa  217  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  29.29 
 
 		 826 aa  217  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  27.34 
 
 		 842 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 		 836 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.47 
 
 		 827 aa  212  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  28.28 
 
 		 847 aa  211  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  28.55 
 
 		 851 aa  211  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  27.09 
 
 		 851 aa  210  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  29.32 
 
 		 833 aa  208  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  28.36 
 
 		 858 aa  207  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  30.55 
 
 		 856 aa  207  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 857 aa  206  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  27 
 
 		 842 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  26.99 
 
 		 819 aa  206  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.64 
 
 		 857 aa  205  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.15 
 
 		 842 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 860 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  29.35 
 
 		 880 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  27.76 
 
 		 839 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.76 
 
 		 804 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 862 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  29.35 
 
 		 1108 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  27.22 
 
 		 834 aa  201  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 		 883 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  28.25 
 
 		 842 aa  200  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  29.09 
 
 		 892 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  27.02 
 
 		 828 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  24.55 
 
 		 810 aa  200  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.64 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  27.64 
 
 		 804 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  23.21 
 
 		 884 aa  198  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  29.79 
 
 		 853 aa  199  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 836 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  27.52 
 
 		 804 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  24.88 
 
 		 815 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  27.04 
 
 		 847 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  25.95 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  24.91 
 
 		 809 aa  194  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  28.3 
 
 		 829 aa  194  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 		 804 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  25.95 
 
 		 809 aa  194  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  22.41 
 
 		 870 aa  193  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  26.71 
 
 		 805 aa  193  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  22.82 
 
 		 882 aa  192  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>